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Kontextmenü: Stil
Unter "Stil" kann die Darstellungsweise von Atomen und Bindungen bestimmt werden:
"Perspektivische Tiefe", "Zeichen-Box", "Elementarzelle" und "Achsen" können ein- oder ausgeschaltet werden. Verschiedene sterographischen Darstellungen sind möglich, wie etwa rot/grün-Stereo oder die Dartellung als Stereopaar
Die Moleküldarstellungs-Optionen werden jeweils nur auf die ausgewählten Atome angewandt. Probieren Sie verschiedene Kombinationen von Atomauswahl und Darstellungsoptionen aus.
"Schema" bietet verschiedenen Grunddarstellungen an:
Mit "CPK Spacefill" werden die Atome als Kalottenmodell, deren Radius dem Van-der-Waals-Radius der Atome entspricht.
Mit "Ball-and-Stick" werden die Bindungen zwischen den Atomen als Zylinder und die Atome als kleine Kugeln dargestellt.
"Sticks" zeigt nur die Bindungen als Zylinder, die Atome werden nicht hervorgehoben, in der "Wireframe"-Darstellung werden die Bindungen nur als dünne Linien angezeigt. Die "Cartoon"-Darstellung ist stark abstrahiert, sie zeigt die Sekundärstruktur von Proteinen und Nukleinsäuren an, ohne die einzelnen Atome und Bindungen darzustellen. "Trace" abstrahiert noch stärker und zeigt nur den Kettenverlauf in Makromolekülen.
Unter "Atome" kann der Radius der Atomkugeln, mit "Beschriftungen" können die Atome angeschrieben werden und mit "Bonds" der Durchmesser der Bindungszylinder individuell eingestellt werden, und . Die Darstellungsweise von Wasserstoffbrücken kann mit "Wasserstoffbrücken", die von Disulfidbrücken mit "Disulfidbindungen" bestimmt werden.
Unter "Strukturen" stehen weitere abstrahierende Darstellungs-weisen für Makromoleküle zur Verfügung: "Backbone" zeigt nur die C-alpha-Atome eines Proteins, durch gerade Linien verbunden, "Cartoon", "Cartoon Rockets", "Ribbons", "Rockets", "Strands", und "Trace" zeigen unterschiedliche Darstellungsweisen des Kettenverlaufs
"Axes" stellt die Koordinatenachsen dar, "Boundbox" einen Quader, der das Molekül umschliesst und "Unitcell" die kristallographische Einheitszelle. Für alle drei kann die Darstellungsweise und Liniendicke verändert werden.
