frank [ on | off ]; Schaltet den Text "Jmol" in der linken unteren Ecke des Molekülfensters ein oder aus.

"echo" erlaubt, im Jmol-Molekülfenster einen Text einzublenden.

set echo [ on | off ];
set echo [ [ top | middle | bottom ] [ left | center | right ] ];
font echo [font-size] [font-face];
color echo [color];
echo "text";

hover [ on | off | string ]; Pop-up Labels, die erscheinen, wenn die Maus über einem Atom verharrt, ein-oder ausschalten, "string" spezifiziert Art des Labels.

label [ on | off | string ]; Permanente Labels an den durch die Auswahl spezifizierten Atomen ein-oder ausschalten, "string" spezifiziert Art des Labels:
%a: Atomname, %A: PDB alt. Lokalisation, %b: B-Faktor, %c: Kette; %C: Formalladung; %e: Element, %i: Atomnummer, %I: Ionenradius, %L: Polymerlänge, %m: Aminosäure im 1-Buchstaben-Code, %M: Model, %n: Monomerbezeichnung im 3-Buchstaben-Code, %N: Molekülnummer, %P: Partialladung, %q: Occupancy; %r: PDB Residue Number, %s: Kette (=%c), %S: Crystallographic Site, %t: Temperaturfaktor (=%b), %U: Vollständige PDB-Bezeichnung (=[%n]%r:%c %a #%i), %V: Van-der-Waals Radius, %x %y %z: kartesische Koordinaten, %X %Y %Z: Fraktionelle Koordinaten

set fontsize [ size ]; Schriftgrösse der Label, Default=8

set labeloffset [ x-offset ] [ y-offset ]; Verschieben des labels relativ zur Default-Position. Positiv: Anzahl Pixel zwischen dem Atomzentrum und dem Beginn des Labels, Null: Label Zentriert auf Atomposition, Negativ: Anzahl Pixel zwischen dem Ende des Labels und der Atomposition.

set labelsFront [ on | off ]; Bestimmt, ob die Labels von weiter vorn stehenden Atomen verdeckt werden oder nicht.