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Die Struktur der Desoxyribonukleinsäure (DNS)

Struktur der (116D.pdb, C.A. Bigman et al, J. Mol. Biol. 227 738 (1992)).

Struktur der (1BNA.pdb, H.R.Drew et al, Proc. Nat. Acad. Sci USA 78 2179 (1981)).

Struktur der (2DCG.pdb, A.H.-J. Wang et al., Nature 282 680 (1979)).

Vergleichen Sie die aus den Darstellungen experimenteller Strukturen bestimmten Werte mit den Angaben aus dem Lehrbuch:

	A-DNA	B-DNA	Z-DNA
Spirale	rechtshändig	rechtshändig	linkshändig
Durchmesser	~26 Å	~20 Å	~18 Å
Basenpaare/Turn	11	10	12 (6x2)
Rotation/Basenpaar	33°	36°	60° / 2bp
Distanz / Turn	28 Å	34 Å	45 Å
Distanz / bp	2.6 Å	3.4 Å	3.7 Å
Basenneigung rel. zur Normalen zur Helixachse	20°	6°	7°
grosse Furche	eng und tief	breit und tief	flach
kleine Furche	breit und flach	eng und tief	eng und tief
Zuckerkonformation	C3'-endo	c2'-endo	C2'-endo (Pyrimidine) C3'-endo (Purine)
Glykosidische Bindung	anti	anti	anti (Pyrimidine) syn (Purine)

Indem Sie nacheinander auf zwei Atome doppelklicken, können Sie deren Distanz voneinander messen. Wie breit sind die grosse und die kleine Furche in den drei verschiedenen Formen der DNA?

Last changed by: A.Honegger, 9/6/08